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一、二本三本合并后还有区别吗
有区别，区别如下：
1、二本三本合并，不是学校合并，是录取批次合并，取消三本批次，并入二本批次，合并招生。
2、三本多为民办和独立学院，毕业证不变。三本学院的学费普遍比较贵。
二、二本与三本的毕业证有什么本质上的区别?
二本与三本的毕业证除签发学校不同外，都是本科，没有本质上的区别。
本科，是大学本科的简称。是高等教育的基本组成部分，学生毕业后一般可获“学士”学位。根据高考要求的录取批次的不同，本科划分为本科提前批、本科一批、本科二批和本科三批。上海市、福建省、山东省、内蒙古自治区、广西壮族自治区、四川省已经将将本科二批和本科三批合并本科二批统一录取。这些录取批次同属于一个层次和学历（即本科学历层次）。
高考中本科按录取先后批次顺序划分为三个批次，一本(包括重本、普本）为第一批次、二本为第二批次、三本为第三批次，每年三本线有考生总成绩而有所不同。一般所谓的“三本”本科高校主要是指：独立学院==独立二级学院（公办民助范畴）、民办高校（纯民本)、中外合作办学的本科专业、本科高校的专本连读专业以及上述高校的普通体育和使用本省联合测试成绩的艺术专业. 三本高校： 具有“校园独立、招生独立、财务独立，但教学管理、师资力量和教学设施等资源都与校本部共享”等特点，可以说，三本院校可以享受知名大学的教育资源和学术氛围。三本院校的学费较高。考生在修完大学四年课程，在三本院校顺利毕业之后，可以获得国家、（国际上）、社会上都承认的“本科毕业证书”和“学士学位证书”等两个证书，与一本和二本大学相同。毕业证书和学位证书都是三本院校自己的证书，并以三本院校自己的高校名称具印。从全国范围看，独立学院自1999年6月诞生，是指普通本科高校依据相关规定，是为了贯彻落实教育部八号文件精神，按照新的机制和模式举办的本科层次的二级学院。独立学院的产生，主要有以下几种方式：国办院校结合企业资本联合举办、民办大学挂靠改制和国办大学独立兴建这三种方式。 在毕业证（也就是学历证明）和学士学位证的区别上，普通一本、二本、三本都是属于“普通高等学校”教育系列，学制都为四年，毕业证书和学位证书都是相同（相等）水平的，是不标明几本的，只表明是本科，都以自己高校的名称具印，都是“普通高等学校”教育证书，所以普通一、二、三本的毕业生都将获得国家、（国际上）、社会上都承认的相同（相等）水平的“普通本科学历证书”。 希望对你能有帮助
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