不合法。单位是无权利扣压工作者的毕业证和学位证原件的,工作者可以直接把原件全拿回,只需要提交复印件就可以。

1、根据劳动合同法第八十四条( 用人单位违反本法规定,扣押劳动者居民身份证等证件的,由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人,并依照有关法律规定给予处罚)规定,公司无权扣押证件。
2、一年内没签劳动合同的可以要求公司支付双倍工资对以上问题你可以向劳动监察大队举报,也可申请仲裁。
学历证明并不是公司注册的必要条件。注册公司需要的材料有:法定代表人、财务、监事的身份证原件,有股东也要股东身份证,公司章程、经营场所的地址证明文件(房产证复印件、购房合同或者租赁合同等,村委小区开的证明也可以),还有5-10个公司名称等。
注册公司的一般流程包括:
1、进行公司名称核名;
2、核名通过后申办营业执照;
3、拿到营业执照后,去已经备案的刻章点刻章;
4、到税务部门备案登记;
5、到银行开立基本户。
劳动合同法第九条规定:用人单位招用劳动者,不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件。
你公司要求你将毕业证,专业资格证书原件交由公司保管,可能有这样一种情况,国家对一些特殊行业要进行监管,对公司内的专业人员有从业资格的要求。因此,每年要进行年检审核,其中专业技术人员的证件就是年检的重点项目,被检查公司按国家的规定应有多少专业技术人员,而这些人员的学历,职称,岗位职业技能证书就是必检材料。
因此,单位保留你的相关证件可能与上述有关。如果是扣押证件就违法了。建议你与公司沟通一下妥善解决。
要看你这个实习证明干什么用,如果是官方用途,部门章是不具备法律效力的。一般来讲,部门章只用作单位内部沟通交流,单位外部,只有公司章即在工商部门注册的章才有法律效力。
但是,如果你只是想在找工作时提供一个实习经历的依据,这个章也能说明一些问题。
还有,如果能让实习单位人事或实习部门负责人给你一个书面的实习表现鉴定并签上名字,可能效果更好!